Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS8

Gm3415, Predicted gene 3415, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3415J3QMS8 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3415J3QMS8 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3415J3QMS8 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3415J3QMS8 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3415J3QMS8 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3415J3QMS8 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3415J3QMS8 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3415J3QMS8 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3415J3QMS8 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3415J3QMS8 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3415J3QMS8 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3415J3QMS8 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3415J3QMS8 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3415J3QMS8 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3415J3QMS8 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3415J3QMS8 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3415J3QMS8 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3415J3QMS8 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3415J3QMS8 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3415J3QMS8 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3415J3QMS8 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3415J3QMS8 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3415J3QMS8 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3415J3QMS8 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3415J3QMS8 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3415J3QMS8 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3415J3QMS8 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3415J3QMS8 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3415J3QMS8 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3415J3QMS8 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3415J3QMS8 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3415J3QMS8 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3415J3QMS8 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3415J3QMS8 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3415J3QMS8 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3415J3QMS8 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3415J3QMS8 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3415J3QMS8 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3415J3QMS8 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3415J3QMS8 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3415J3QMS8 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3415J3QMS8 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3415J3QMS8 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3415J3QMS8 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3415J3QMS8 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3415J3QMS8 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3415J3QMS8 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3415J3QMS8 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3415J3QMS8 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3415J3QMS8 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3415J3QMS8 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3415J3QMS8 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3415J3QMS8 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3415J3QMS8 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3415J3QMS8 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3415J3QMS8 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3415J3QMS8 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3415J3QMS8 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3415J3QMS8 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3415J3QMS8 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3415J3QMS8 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3415J3QMS8 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3415J3QMS8 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3415J3QMS8 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3415J3QMS8 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3415J3QMS8 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3415J3QMS8 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3415J3QMS8 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3415J3QMS8 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3415J3QMS8 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3415J3QMS8 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3415J3QMS8 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3415J3QMS8 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3415J3QMS8 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3415J3QMS8 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3415J3QMS8 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3415J3QMS8 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3415J3QMS8 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3415J3QMS8 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3415J3QMS8 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3415J3QMS8 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3415J3QMS8 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3415J3QMS8 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3415J3QMS8 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3415J3QMS8 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3415J3QMS8 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3415J3QMS8 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3415J3QMS8 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3415J3QMS8 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3415J3QMS8 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3415J3QMS8 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3415J3QMS8 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3415J3QMS8 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3415J3QMS8 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3415J3QMS8 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3415J3QMS8 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3415J3QMS8 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3415J3QMS8 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3415J3QMS8 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3415J3QMS8 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms