Protein–RNA interactions for Protein: J3QMI4

Calhm3, Calcium homeostasis modulator 3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calhm3J3QMI4 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Calhm3J3QMI4 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Calhm3J3QMI4 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Calhm3J3QMI4 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Calhm3J3QMI4 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Calhm3J3QMI4 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Calhm3J3QMI4 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Calhm3J3QMI4 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Calhm3J3QMI4 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Calhm3J3QMI4 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Calhm3J3QMI4 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Calhm3J3QMI4 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Calhm3J3QMI4 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Calhm3J3QMI4 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Calhm3J3QMI4 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Calhm3J3QMI4 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Calhm3J3QMI4 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Calhm3J3QMI4 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Calhm3J3QMI4 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Calhm3J3QMI4 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Calhm3J3QMI4 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Calhm3J3QMI4 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Calhm3J3QMI4 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Calhm3J3QMI4 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Calhm3J3QMI4 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Calhm3J3QMI4 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Calhm3J3QMI4 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Calhm3J3QMI4 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Calhm3J3QMI4 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Calhm3J3QMI4 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Calhm3J3QMI4 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Calhm3J3QMI4 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Calhm3J3QMI4 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Calhm3J3QMI4 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Calhm3J3QMI4 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Calhm3J3QMI4 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Calhm3J3QMI4 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Calhm3J3QMI4 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Calhm3J3QMI4 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Calhm3J3QMI4 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Calhm3J3QMI4 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Calhm3J3QMI4 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Calhm3J3QMI4 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Calhm3J3QMI4 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Calhm3J3QMI4 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Calhm3J3QMI4 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Calhm3J3QMI4 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Calhm3J3QMI4 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Calhm3J3QMI4 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Calhm3J3QMI4 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Calhm3J3QMI4 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Calhm3J3QMI4 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Calhm3J3QMI4 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Calhm3J3QMI4 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Calhm3J3QMI4 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Calhm3J3QMI4 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Calhm3J3QMI4 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Calhm3J3QMI4 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Calhm3J3QMI4 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Calhm3J3QMI4 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Calhm3J3QMI4 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Calhm3J3QMI4 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Calhm3J3QMI4 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Calhm3J3QMI4 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Calhm3J3QMI4 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Calhm3J3QMI4 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Calhm3J3QMI4 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Calhm3J3QMI4 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Calhm3J3QMI4 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Calhm3J3QMI4 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Calhm3J3QMI4 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Calhm3J3QMI4 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Calhm3J3QMI4 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Calhm3J3QMI4 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Calhm3J3QMI4 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Calhm3J3QMI4 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Calhm3J3QMI4 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Calhm3J3QMI4 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Calhm3J3QMI4 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Calhm3J3QMI4 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Calhm3J3QMI4 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Calhm3J3QMI4 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Calhm3J3QMI4 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Calhm3J3QMI4 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Calhm3J3QMI4 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Calhm3J3QMI4 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Calhm3J3QMI4 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Calhm3J3QMI4 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Calhm3J3QMI4 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Calhm3J3QMI4 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Calhm3J3QMI4 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Calhm3J3QMI4 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Calhm3J3QMI4 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Calhm3J3QMI4 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Calhm3J3QMI4 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Calhm3J3QMI4 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Calhm3J3QMI4 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Calhm3J3QMI4 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Calhm3J3QMI4 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Calhm3J3QMI4 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms