Protein–RNA interactions for Protein: J3QK56

4930544D05Rik, RIKEN cDNA 4930544D05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930544D05RikJ3QK56 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms