Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms