Protein–RNA interactions for Protein: I3ITR1

AK157302, MCG50313, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AK157302I3ITR1 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AK157302I3ITR1 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AK157302I3ITR1 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AK157302I3ITR1 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AK157302I3ITR1 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AK157302I3ITR1 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AK157302I3ITR1 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AK157302I3ITR1 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AK157302I3ITR1 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AK157302I3ITR1 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AK157302I3ITR1 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AK157302I3ITR1 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AK157302I3ITR1 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AK157302I3ITR1 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AK157302I3ITR1 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
AK157302I3ITR1 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
AK157302I3ITR1 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AK157302I3ITR1 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AK157302I3ITR1 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AK157302I3ITR1 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
AK157302I3ITR1 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
AK157302I3ITR1 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
AK157302I3ITR1 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AK157302I3ITR1 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
AK157302I3ITR1 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AK157302I3ITR1 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AK157302I3ITR1 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AK157302I3ITR1 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AK157302I3ITR1 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AK157302I3ITR1 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AK157302I3ITR1 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AK157302I3ITR1 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AK157302I3ITR1 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
AK157302I3ITR1 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AK157302I3ITR1 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AK157302I3ITR1 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AK157302I3ITR1 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AK157302I3ITR1 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AK157302I3ITR1 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
AK157302I3ITR1 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AK157302I3ITR1 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AK157302I3ITR1 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AK157302I3ITR1 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
AK157302I3ITR1 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
AK157302I3ITR1 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
AK157302I3ITR1 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
AK157302I3ITR1 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AK157302I3ITR1 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
AK157302I3ITR1 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AK157302I3ITR1 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AK157302I3ITR1 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AK157302I3ITR1 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AK157302I3ITR1 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AK157302I3ITR1 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AK157302I3ITR1 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AK157302I3ITR1 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AK157302I3ITR1 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AK157302I3ITR1 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AK157302I3ITR1 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AK157302I3ITR1 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
AK157302I3ITR1 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
AK157302I3ITR1 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AK157302I3ITR1 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AK157302I3ITR1 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AK157302I3ITR1 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AK157302I3ITR1 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AK157302I3ITR1 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AK157302I3ITR1 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AK157302I3ITR1 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AK157302I3ITR1 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
AK157302I3ITR1 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
AK157302I3ITR1 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
AK157302I3ITR1 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
AK157302I3ITR1 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AK157302I3ITR1 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AK157302I3ITR1 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
AK157302I3ITR1 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AK157302I3ITR1 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AK157302I3ITR1 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AK157302I3ITR1 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AK157302I3ITR1 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AK157302I3ITR1 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
AK157302I3ITR1 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
AK157302I3ITR1 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
AK157302I3ITR1 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
AK157302I3ITR1 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
AK157302I3ITR1 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
AK157302I3ITR1 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
AK157302I3ITR1 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
AK157302I3ITR1 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
AK157302I3ITR1 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
AK157302I3ITR1 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
AK157302I3ITR1 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
AK157302I3ITR1 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
AK157302I3ITR1 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
AK157302I3ITR1 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
AK157302I3ITR1 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
AK157302I3ITR1 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
AK157302I3ITR1 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
AK157302I3ITR1 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms