Protein–RNA interactions for Protein: G3X9Z4

Pcf11, Cleavage and polyadenylation factor subunit homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Predictions only

Length 1,553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcf11G3X9Z4 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcf11G3X9Z4 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcf11G3X9Z4 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcf11G3X9Z4 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcf11G3X9Z4 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcf11G3X9Z4 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcf11G3X9Z4 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcf11G3X9Z4 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcf11G3X9Z4 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcf11G3X9Z4 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcf11G3X9Z4 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcf11G3X9Z4 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcf11G3X9Z4 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcf11G3X9Z4 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcf11G3X9Z4 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcf11G3X9Z4 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcf11G3X9Z4 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcf11G3X9Z4 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcf11G3X9Z4 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcf11G3X9Z4 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcf11G3X9Z4 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pcf11G3X9Z4 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pcf11G3X9Z4 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pcf11G3X9Z4 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pcf11G3X9Z4 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pcf11G3X9Z4 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pcf11G3X9Z4 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pcf11G3X9Z4 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pcf11G3X9Z4 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pcf11G3X9Z4 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Pcf11G3X9Z4 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcf11G3X9Z4 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcf11G3X9Z4 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcf11G3X9Z4 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcf11G3X9Z4 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcf11G3X9Z4 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcf11G3X9Z4 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcf11G3X9Z4 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcf11G3X9Z4 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcf11G3X9Z4 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcf11G3X9Z4 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcf11G3X9Z4 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcf11G3X9Z4 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcf11G3X9Z4 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcf11G3X9Z4 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcf11G3X9Z4 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcf11G3X9Z4 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcf11G3X9Z4 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcf11G3X9Z4 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcf11G3X9Z4 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcf11G3X9Z4 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcf11G3X9Z4 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcf11G3X9Z4 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcf11G3X9Z4 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcf11G3X9Z4 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcf11G3X9Z4 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcf11G3X9Z4 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcf11G3X9Z4 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcf11G3X9Z4 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcf11G3X9Z4 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcf11G3X9Z4 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcf11G3X9Z4 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcf11G3X9Z4 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcf11G3X9Z4 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcf11G3X9Z4 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcf11G3X9Z4 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcf11G3X9Z4 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcf11G3X9Z4 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcf11G3X9Z4 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcf11G3X9Z4 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcf11G3X9Z4 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcf11G3X9Z4 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcf11G3X9Z4 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcf11G3X9Z4 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcf11G3X9Z4 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcf11G3X9Z4 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcf11G3X9Z4 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcf11G3X9Z4 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcf11G3X9Z4 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcf11G3X9Z4 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcf11G3X9Z4 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcf11G3X9Z4 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcf11G3X9Z4 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcf11G3X9Z4 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcf11G3X9Z4 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcf11G3X9Z4 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcf11G3X9Z4 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcf11G3X9Z4 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcf11G3X9Z4 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcf11G3X9Z4 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcf11G3X9Z4 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcf11G3X9Z4 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcf11G3X9Z4 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcf11G3X9Z4 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcf11G3X9Z4 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcf11G3X9Z4 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcf11G3X9Z4 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcf11G3X9Z4 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcf11G3X9Z4 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcf11G3X9Z4 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms