Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Vmn1r58G3X9U3 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Vmn1r58G3X9U3 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Vmn1r58G3X9U3 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Vmn1r58G3X9U3 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Vmn1r58G3X9U3 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Vmn1r58G3X9U3 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Vmn1r58G3X9U3 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Vmn1r58G3X9U3 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Vmn1r58G3X9U3 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms