Protein–RNA interactions for Protein: G3X9K3

Arfgef1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef1G3X9K3 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Arfgef1G3X9K3 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Arfgef1G3X9K3 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Arfgef1G3X9K3 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Arfgef1G3X9K3 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Arfgef1G3X9K3 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Arfgef1G3X9K3 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Arfgef1G3X9K3 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Arfgef1G3X9K3 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Arfgef1G3X9K3 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Arfgef1G3X9K3 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Arfgef1G3X9K3 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Arfgef1G3X9K3 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Arfgef1G3X9K3 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Arfgef1G3X9K3 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Arfgef1G3X9K3 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Arfgef1G3X9K3 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Arfgef1G3X9K3 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Arfgef1G3X9K3 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Arfgef1G3X9K3 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Arfgef1G3X9K3 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Arfgef1G3X9K3 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Arfgef1G3X9K3 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Arfgef1G3X9K3 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Arfgef1G3X9K3 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Arfgef1G3X9K3 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Arfgef1G3X9K3 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Arfgef1G3X9K3 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Arfgef1G3X9K3 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Arfgef1G3X9K3 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Arfgef1G3X9K3 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Arfgef1G3X9K3 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Arfgef1G3X9K3 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Arfgef1G3X9K3 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Arfgef1G3X9K3 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Arfgef1G3X9K3 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Arfgef1G3X9K3 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Arfgef1G3X9K3 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Arfgef1G3X9K3 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Arfgef1G3X9K3 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Arfgef1G3X9K3 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Arfgef1G3X9K3 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Arfgef1G3X9K3 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Arfgef1G3X9K3 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Arfgef1G3X9K3 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Arfgef1G3X9K3 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Arfgef1G3X9K3 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Arfgef1G3X9K3 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Arfgef1G3X9K3 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Arfgef1G3X9K3 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Arfgef1G3X9K3 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Arfgef1G3X9K3 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Arfgef1G3X9K3 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Arfgef1G3X9K3 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Arfgef1G3X9K3 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Arfgef1G3X9K3 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Arfgef1G3X9K3 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Arfgef1G3X9K3 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Arfgef1G3X9K3 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Arfgef1G3X9K3 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Arfgef1G3X9K3 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Arfgef1G3X9K3 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Arfgef1G3X9K3 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Arfgef1G3X9K3 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Arfgef1G3X9K3 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Arfgef1G3X9K3 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Arfgef1G3X9K3 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Arfgef1G3X9K3 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Arfgef1G3X9K3 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Arfgef1G3X9K3 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Arfgef1G3X9K3 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Arfgef1G3X9K3 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Arfgef1G3X9K3 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Arfgef1G3X9K3 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Arfgef1G3X9K3 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Arfgef1G3X9K3 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Arfgef1G3X9K3 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Arfgef1G3X9K3 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Arfgef1G3X9K3 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Arfgef1G3X9K3 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Arfgef1G3X9K3 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Arfgef1G3X9K3 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Arfgef1G3X9K3 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Arfgef1G3X9K3 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Arfgef1G3X9K3 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Arfgef1G3X9K3 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Arfgef1G3X9K3 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Arfgef1G3X9K3 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Arfgef1G3X9K3 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Arfgef1G3X9K3 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Arfgef1G3X9K3 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Arfgef1G3X9K3 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Arfgef1G3X9K3 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Arfgef1G3X9K3 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Arfgef1G3X9K3 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Arfgef1G3X9K3 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Arfgef1G3X9K3 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Arfgef1G3X9K3 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Arfgef1G3X9K3 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Arfgef1G3X9K3 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms