Protein–RNA interactions for Protein: G3UW71

Vmn1r167, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r167G3UW71 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r167G3UW71 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r167G3UW71 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r167G3UW71 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r167G3UW71 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r167G3UW71 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r167G3UW71 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vmn1r167G3UW71 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vmn1r167G3UW71 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vmn1r167G3UW71 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vmn1r167G3UW71 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vmn1r167G3UW71 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vmn1r167G3UW71 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vmn1r167G3UW71 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vmn1r167G3UW71 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vmn1r167G3UW71 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vmn1r167G3UW71 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vmn1r167G3UW71 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vmn1r167G3UW71 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vmn1r167G3UW71 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vmn1r167G3UW71 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vmn1r167G3UW71 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vmn1r167G3UW71 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vmn1r167G3UW71 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vmn1r167G3UW71 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vmn1r167G3UW71 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vmn1r167G3UW71 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vmn1r167G3UW71 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vmn1r167G3UW71 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vmn1r167G3UW71 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vmn1r167G3UW71 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vmn1r167G3UW71 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vmn1r167G3UW71 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vmn1r167G3UW71 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vmn1r167G3UW71 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vmn1r167G3UW71 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vmn1r167G3UW71 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vmn1r167G3UW71 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vmn1r167G3UW71 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vmn1r167G3UW71 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vmn1r167G3UW71 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vmn1r167G3UW71 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vmn1r167G3UW71 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vmn1r167G3UW71 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vmn1r167G3UW71 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vmn1r167G3UW71 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vmn1r167G3UW71 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vmn1r167G3UW71 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vmn1r167G3UW71 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vmn1r167G3UW71 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vmn1r167G3UW71 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vmn1r167G3UW71 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vmn1r167G3UW71 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vmn1r167G3UW71 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vmn1r167G3UW71 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Vmn1r167G3UW71 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vmn1r167G3UW71 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vmn1r167G3UW71 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vmn1r167G3UW71 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vmn1r167G3UW71 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Vmn1r167G3UW71 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vmn1r167G3UW71 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vmn1r167G3UW71 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Vmn1r167G3UW71 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vmn1r167G3UW71 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vmn1r167G3UW71 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vmn1r167G3UW71 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vmn1r167G3UW71 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vmn1r167G3UW71 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vmn1r167G3UW71 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vmn1r167G3UW71 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vmn1r167G3UW71 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vmn1r167G3UW71 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vmn1r167G3UW71 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vmn1r167G3UW71 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vmn1r167G3UW71 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vmn1r167G3UW71 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vmn1r167G3UW71 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vmn1r167G3UW71 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vmn1r167G3UW71 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vmn1r167G3UW71 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vmn1r167G3UW71 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vmn1r167G3UW71 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vmn1r167G3UW71 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vmn1r167G3UW71 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vmn1r167G3UW71 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Vmn1r167G3UW71 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vmn1r167G3UW71 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vmn1r167G3UW71 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vmn1r167G3UW71 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vmn1r167G3UW71 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vmn1r167G3UW71 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vmn1r167G3UW71 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vmn1r167G3UW71 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vmn1r167G3UW71 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vmn1r167G3UW71 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Vmn1r167G3UW71 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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