Protein–RNA interactions for Protein: F8VQC1

Srp72, Signal recognition particle subunit SRP72, mousemouse

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Length 671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp72F8VQC1 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Srp72F8VQC1 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Srp72F8VQC1 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Srp72F8VQC1 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Srp72F8VQC1 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Srp72F8VQC1 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Srp72F8VQC1 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Srp72F8VQC1 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Srp72F8VQC1 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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