Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU2

Farp1, FERM, ARHGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Farp1F8VPU2 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Gm37436-201ENSMUST00000193842 1085 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Prr9-201ENSMUST00000070284 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Gm22885-201ENSMUST00000157410 107 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Gm28877-201ENSMUST00000191349 604 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Farp1F8VPU2 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Farp1F8VPU2 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Farp1F8VPU2 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Farp1F8VPU2 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Farp1F8VPU2 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Farp1F8VPU2 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Farp1F8VPU2 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Farp1F8VPU2 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Farp1F8VPU2 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Farp1F8VPU2 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Farp1F8VPU2 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Farp1F8VPU2 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Farp1F8VPU2 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms