Protein–RNA interactions for Protein: F7CQW8

Gm3371, Predicted gene 3371 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3371F7CQW8 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3371F7CQW8 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3371F7CQW8 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3371F7CQW8 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3371F7CQW8 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3371F7CQW8 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3371F7CQW8 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3371F7CQW8 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3371F7CQW8 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3371F7CQW8 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3371F7CQW8 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3371F7CQW8 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3371F7CQW8 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3371F7CQW8 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3371F7CQW8 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3371F7CQW8 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3371F7CQW8 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3371F7CQW8 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3371F7CQW8 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3371F7CQW8 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3371F7CQW8 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3371F7CQW8 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3371F7CQW8 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3371F7CQW8 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3371F7CQW8 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3371F7CQW8 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3371F7CQW8 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3371F7CQW8 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3371F7CQW8 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3371F7CQW8 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3371F7CQW8 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3371F7CQW8 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3371F7CQW8 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3371F7CQW8 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3371F7CQW8 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3371F7CQW8 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3371F7CQW8 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3371F7CQW8 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3371F7CQW8 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3371F7CQW8 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3371F7CQW8 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3371F7CQW8 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3371F7CQW8 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3371F7CQW8 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3371F7CQW8 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3371F7CQW8 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3371F7CQW8 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3371F7CQW8 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3371F7CQW8 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3371F7CQW8 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3371F7CQW8 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3371F7CQW8 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3371F7CQW8 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3371F7CQW8 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3371F7CQW8 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3371F7CQW8 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3371F7CQW8 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3371F7CQW8 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3371F7CQW8 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3371F7CQW8 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3371F7CQW8 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3371F7CQW8 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3371F7CQW8 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3371F7CQW8 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3371F7CQW8 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3371F7CQW8 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3371F7CQW8 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3371F7CQW8 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3371F7CQW8 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3371F7CQW8 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3371F7CQW8 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3371F7CQW8 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3371F7CQW8 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3371F7CQW8 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3371F7CQW8 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3371F7CQW8 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3371F7CQW8 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3371F7CQW8 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3371F7CQW8 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3371F7CQW8 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3371F7CQW8 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3371F7CQW8 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3371F7CQW8 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3371F7CQW8 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3371F7CQW8 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3371F7CQW8 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3371F7CQW8 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3371F7CQW8 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3371F7CQW8 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3371F7CQW8 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3371F7CQW8 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3371F7CQW8 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3371F7CQW8 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3371F7CQW8 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3371F7CQW8 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3371F7CQW8 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3371F7CQW8 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3371F7CQW8 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3371F7CQW8 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3371F7CQW8 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms