Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN9

Gm28038, Predicted gene, 28038 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28038F7BCN9 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Gm8502-201ENSMUST00000185708 901 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Gm21147-201ENSMUST00000186046 913 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Gm8510-201ENSMUST00000189202 895 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Gm2316-201ENSMUST00000190613 921 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Gm11361-201ENSMUST00000223428 607 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Sox5os1-201ENSMUST00000156994 1585 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Gm37592-201ENSMUST00000192741 373 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms