Protein–RNA interactions for Protein: F6XWB2

Igkv1-99, Immunoglobulin kappa variable 1-99 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igkv1-99F6XWB2 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Igkv1-99F6XWB2 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms