Protein–RNA interactions for Protein: F6VAN0

Atf6, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 alpha, mousemouse

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Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6F6VAN0 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atf6F6VAN0 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atf6F6VAN0 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atf6F6VAN0 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atf6F6VAN0 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atf6F6VAN0 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atf6F6VAN0 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atf6F6VAN0 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atf6F6VAN0 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atf6F6VAN0 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atf6F6VAN0 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atf6F6VAN0 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Atf6F6VAN0 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atf6F6VAN0 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atf6F6VAN0 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atf6F6VAN0 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Atf6F6VAN0 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atf6F6VAN0 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atf6F6VAN0 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atf6F6VAN0 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atf6F6VAN0 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atf6F6VAN0 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atf6F6VAN0 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atf6F6VAN0 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atf6F6VAN0 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atf6F6VAN0 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atf6F6VAN0 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atf6F6VAN0 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atf6F6VAN0 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atf6F6VAN0 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atf6F6VAN0 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atf6F6VAN0 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atf6F6VAN0 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atf6F6VAN0 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atf6F6VAN0 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atf6F6VAN0 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atf6F6VAN0 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atf6F6VAN0 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atf6F6VAN0 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atf6F6VAN0 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atf6F6VAN0 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atf6F6VAN0 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atf6F6VAN0 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atf6F6VAN0 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atf6F6VAN0 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atf6F6VAN0 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atf6F6VAN0 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Atf6F6VAN0 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atf6F6VAN0 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atf6F6VAN0 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atf6F6VAN0 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atf6F6VAN0 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atf6F6VAN0 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atf6F6VAN0 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atf6F6VAN0 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atf6F6VAN0 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atf6F6VAN0 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atf6F6VAN0 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atf6F6VAN0 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atf6F6VAN0 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Atf6F6VAN0 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atf6F6VAN0 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atf6F6VAN0 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atf6F6VAN0 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atf6F6VAN0 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atf6F6VAN0 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atf6F6VAN0 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atf6F6VAN0 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atf6F6VAN0 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atf6F6VAN0 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atf6F6VAN0 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atf6F6VAN0 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atf6F6VAN0 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atf6F6VAN0 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atf6F6VAN0 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atf6F6VAN0 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atf6F6VAN0 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atf6F6VAN0 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atf6F6VAN0 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atf6F6VAN0 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atf6F6VAN0 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atf6F6VAN0 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atf6F6VAN0 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Atf6F6VAN0 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atf6F6VAN0 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atf6F6VAN0 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atf6F6VAN0 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atf6F6VAN0 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atf6F6VAN0 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atf6F6VAN0 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atf6F6VAN0 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Atf6F6VAN0 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atf6F6VAN0 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atf6F6VAN0 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atf6F6VAN0 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atf6F6VAN0 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atf6F6VAN0 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atf6F6VAN0 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atf6F6VAN0 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atf6F6VAN0 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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