Protein–RNA interactions for Protein: F6TQD1

Rnf212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf212F6TQD1 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms