Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Y3

Ccdc7b, Coiled-coil domain-containing 7B, mousemouse

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Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7bE9Q9Y3 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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