Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5E2

BC005561, cDNA sequence BC005561, mousemouse

Predictions only

Length 1,589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC005561E9Q5E2 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BC005561E9Q5E2 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BC005561E9Q5E2 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BC005561E9Q5E2 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BC005561E9Q5E2 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BC005561E9Q5E2 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BC005561E9Q5E2 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BC005561E9Q5E2 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BC005561E9Q5E2 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
BC005561E9Q5E2 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BC005561E9Q5E2 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BC005561E9Q5E2 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BC005561E9Q5E2 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BC005561E9Q5E2 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BC005561E9Q5E2 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BC005561E9Q5E2 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BC005561E9Q5E2 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BC005561E9Q5E2 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BC005561E9Q5E2 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BC005561E9Q5E2 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BC005561E9Q5E2 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BC005561E9Q5E2 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BC005561E9Q5E2 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BC005561E9Q5E2 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
BC005561E9Q5E2 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BC005561E9Q5E2 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BC005561E9Q5E2 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BC005561E9Q5E2 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BC005561E9Q5E2 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BC005561E9Q5E2 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BC005561E9Q5E2 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
BC005561E9Q5E2 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BC005561E9Q5E2 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BC005561E9Q5E2 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BC005561E9Q5E2 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BC005561E9Q5E2 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BC005561E9Q5E2 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
BC005561E9Q5E2 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BC005561E9Q5E2 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BC005561E9Q5E2 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BC005561E9Q5E2 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BC005561E9Q5E2 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BC005561E9Q5E2 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BC005561E9Q5E2 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BC005561E9Q5E2 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
BC005561E9Q5E2 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BC005561E9Q5E2 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BC005561E9Q5E2 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BC005561E9Q5E2 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BC005561E9Q5E2 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BC005561E9Q5E2 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BC005561E9Q5E2 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BC005561E9Q5E2 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BC005561E9Q5E2 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
BC005561E9Q5E2 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BC005561E9Q5E2 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BC005561E9Q5E2 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BC005561E9Q5E2 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BC005561E9Q5E2 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
BC005561E9Q5E2 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BC005561E9Q5E2 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BC005561E9Q5E2 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BC005561E9Q5E2 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BC005561E9Q5E2 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BC005561E9Q5E2 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BC005561E9Q5E2 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BC005561E9Q5E2 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
BC005561E9Q5E2 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BC005561E9Q5E2 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BC005561E9Q5E2 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BC005561E9Q5E2 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BC005561E9Q5E2 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BC005561E9Q5E2 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BC005561E9Q5E2 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BC005561E9Q5E2 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BC005561E9Q5E2 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BC005561E9Q5E2 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BC005561E9Q5E2 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BC005561E9Q5E2 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BC005561E9Q5E2 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BC005561E9Q5E2 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BC005561E9Q5E2 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BC005561E9Q5E2 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
BC005561E9Q5E2 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BC005561E9Q5E2 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
BC005561E9Q5E2 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BC005561E9Q5E2 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BC005561E9Q5E2 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BC005561E9Q5E2 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BC005561E9Q5E2 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BC005561E9Q5E2 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BC005561E9Q5E2 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BC005561E9Q5E2 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BC005561E9Q5E2 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BC005561E9Q5E2 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BC005561E9Q5E2 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BC005561E9Q5E2 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BC005561E9Q5E2 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BC005561E9Q5E2 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BC005561E9Q5E2 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms