Protein–RNA interactions for Protein: E9Q548

Gm20518, Predicted gene 20518, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20518E9Q548 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20518E9Q548 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20518E9Q548 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20518E9Q548 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20518E9Q548 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20518E9Q548 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20518E9Q548 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20518E9Q548 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20518E9Q548 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20518E9Q548 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20518E9Q548 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20518E9Q548 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20518E9Q548 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Gm20518E9Q548 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Gm20518E9Q548 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20518E9Q548 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20518E9Q548 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20518E9Q548 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20518E9Q548 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20518E9Q548 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20518E9Q548 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20518E9Q548 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20518E9Q548 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20518E9Q548 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20518E9Q548 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20518E9Q548 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20518E9Q548 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20518E9Q548 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20518E9Q548 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20518E9Q548 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20518E9Q548 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20518E9Q548 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20518E9Q548 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20518E9Q548 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20518E9Q548 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20518E9Q548 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20518E9Q548 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20518E9Q548 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20518E9Q548 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20518E9Q548 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20518E9Q548 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20518E9Q548 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20518E9Q548 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20518E9Q548 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20518E9Q548 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20518E9Q548 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20518E9Q548 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20518E9Q548 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20518E9Q548 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20518E9Q548 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20518E9Q548 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20518E9Q548 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20518E9Q548 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20518E9Q548 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20518E9Q548 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20518E9Q548 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20518E9Q548 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20518E9Q548 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20518E9Q548 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20518E9Q548 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20518E9Q548 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20518E9Q548 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20518E9Q548 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20518E9Q548 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20518E9Q548 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20518E9Q548 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20518E9Q548 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20518E9Q548 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20518E9Q548 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20518E9Q548 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20518E9Q548 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20518E9Q548 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20518E9Q548 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20518E9Q548 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20518E9Q548 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20518E9Q548 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20518E9Q548 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20518E9Q548 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20518E9Q548 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20518E9Q548 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20518E9Q548 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20518E9Q548 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20518E9Q548 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20518E9Q548 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20518E9Q548 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20518E9Q548 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20518E9Q548 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20518E9Q548 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20518E9Q548 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20518E9Q548 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20518E9Q548 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20518E9Q548 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20518E9Q548 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20518E9Q548 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20518E9Q548 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20518E9Q548 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20518E9Q548 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20518E9Q548 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20518E9Q548 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20518E9Q548 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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