Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
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ApobE9Q414 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
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ApobE9Q414 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
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ApobE9Q414 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
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ApobE9Q414 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
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ApobE9Q414 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
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ApobE9Q414 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
ApobE9Q414 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
ApobE9Q414 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
ApobE9Q414 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
ApobE9Q414 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
ApobE9Q414 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
ApobE9Q414 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
ApobE9Q414 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
ApobE9Q414 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
ApobE9Q414 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
ApobE9Q414 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC8.88□□□□□ -0.99
ApobE9Q414 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
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