Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3H4

Susd1, Sushi domain-containing 1, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd1E9Q3H4 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Susd1E9Q3H4 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Susd1E9Q3H4 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Susd1E9Q3H4 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Susd1E9Q3H4 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Susd1E9Q3H4 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Susd1E9Q3H4 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Susd1E9Q3H4 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Susd1E9Q3H4 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Susd1E9Q3H4 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Susd1E9Q3H4 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Susd1E9Q3H4 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Susd1E9Q3H4 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Susd1E9Q3H4 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Susd1E9Q3H4 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Susd1E9Q3H4 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Susd1E9Q3H4 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Susd1E9Q3H4 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Susd1E9Q3H4 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Susd1E9Q3H4 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Susd1E9Q3H4 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Susd1E9Q3H4 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Susd1E9Q3H4 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Susd1E9Q3H4 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Susd1E9Q3H4 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Susd1E9Q3H4 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Susd1E9Q3H4 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Susd1E9Q3H4 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Susd1E9Q3H4 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Susd1E9Q3H4 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Susd1E9Q3H4 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Susd1E9Q3H4 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Susd1E9Q3H4 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Susd1E9Q3H4 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Susd1E9Q3H4 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Susd1E9Q3H4 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Susd1E9Q3H4 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Susd1E9Q3H4 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Susd1E9Q3H4 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Susd1E9Q3H4 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Susd1E9Q3H4 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Susd1E9Q3H4 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Susd1E9Q3H4 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Susd1E9Q3H4 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Susd1E9Q3H4 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Susd1E9Q3H4 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Susd1E9Q3H4 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Susd1E9Q3H4 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Susd1E9Q3H4 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Susd1E9Q3H4 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Susd1E9Q3H4 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Susd1E9Q3H4 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Susd1E9Q3H4 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Susd1E9Q3H4 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Susd1E9Q3H4 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Susd1E9Q3H4 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Susd1E9Q3H4 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Susd1E9Q3H4 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Susd1E9Q3H4 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Susd1E9Q3H4 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Susd1E9Q3H4 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Susd1E9Q3H4 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Susd1E9Q3H4 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Susd1E9Q3H4 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Susd1E9Q3H4 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Susd1E9Q3H4 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Susd1E9Q3H4 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Susd1E9Q3H4 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Susd1E9Q3H4 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Susd1E9Q3H4 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Susd1E9Q3H4 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Susd1E9Q3H4 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Susd1E9Q3H4 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Susd1E9Q3H4 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Susd1E9Q3H4 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Susd1E9Q3H4 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Susd1E9Q3H4 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Susd1E9Q3H4 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Susd1E9Q3H4 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Susd1E9Q3H4 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Susd1E9Q3H4 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Susd1E9Q3H4 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Susd1E9Q3H4 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Susd1E9Q3H4 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Susd1E9Q3H4 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Susd1E9Q3H4 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Susd1E9Q3H4 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Susd1E9Q3H4 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Susd1E9Q3H4 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Susd1E9Q3H4 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Susd1E9Q3H4 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Susd1E9Q3H4 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Susd1E9Q3H4 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Susd1E9Q3H4 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Susd1E9Q3H4 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Susd1E9Q3H4 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Susd1E9Q3H4 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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