Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1F5

Myo5c, Myosin VC, mousemouse

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Length 1,742 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5cE9Q1F5 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Myo5cE9Q1F5 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Myo5cE9Q1F5 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Myo5cE9Q1F5 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Myo5cE9Q1F5 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Myo5cE9Q1F5 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Myo5cE9Q1F5 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Myo5cE9Q1F5 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Myo5cE9Q1F5 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Myo5cE9Q1F5 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Myo5cE9Q1F5 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Myo5cE9Q1F5 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Myo5cE9Q1F5 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Myo5cE9Q1F5 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Myo5cE9Q1F5 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Myo5cE9Q1F5 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Myo5cE9Q1F5 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Myo5cE9Q1F5 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Myo5cE9Q1F5 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Myo5cE9Q1F5 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Myo5cE9Q1F5 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Myo5cE9Q1F5 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Myo5cE9Q1F5 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Myo5cE9Q1F5 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Myo5cE9Q1F5 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Myo5cE9Q1F5 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Myo5cE9Q1F5 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Myo5cE9Q1F5 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Myo5cE9Q1F5 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Myo5cE9Q1F5 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Myo5cE9Q1F5 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Myo5cE9Q1F5 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Myo5cE9Q1F5 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Myo5cE9Q1F5 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Myo5cE9Q1F5 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Myo5cE9Q1F5 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Myo5cE9Q1F5 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Myo5cE9Q1F5 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Myo5cE9Q1F5 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Myo5cE9Q1F5 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Myo5cE9Q1F5 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Myo5cE9Q1F5 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Myo5cE9Q1F5 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Myo5cE9Q1F5 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Myo5cE9Q1F5 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Myo5cE9Q1F5 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Myo5cE9Q1F5 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Myo5cE9Q1F5 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Myo5cE9Q1F5 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Myo5cE9Q1F5 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Myo5cE9Q1F5 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Myo5cE9Q1F5 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Myo5cE9Q1F5 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Myo5cE9Q1F5 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Myo5cE9Q1F5 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Myo5cE9Q1F5 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Myo5cE9Q1F5 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Myo5cE9Q1F5 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Myo5cE9Q1F5 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Myo5cE9Q1F5 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Myo5cE9Q1F5 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Myo5cE9Q1F5 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Myo5cE9Q1F5 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Myo5cE9Q1F5 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Myo5cE9Q1F5 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Myo5cE9Q1F5 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Myo5cE9Q1F5 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Myo5cE9Q1F5 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Myo5cE9Q1F5 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Myo5cE9Q1F5 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Myo5cE9Q1F5 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Myo5cE9Q1F5 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Myo5cE9Q1F5 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Myo5cE9Q1F5 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Myo5cE9Q1F5 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Myo5cE9Q1F5 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Myo5cE9Q1F5 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Myo5cE9Q1F5 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Myo5cE9Q1F5 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Myo5cE9Q1F5 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Myo5cE9Q1F5 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Myo5cE9Q1F5 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Myo5cE9Q1F5 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Myo5cE9Q1F5 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Myo5cE9Q1F5 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Myo5cE9Q1F5 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Myo5cE9Q1F5 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Myo5cE9Q1F5 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Myo5cE9Q1F5 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Myo5cE9Q1F5 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Myo5cE9Q1F5 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Myo5cE9Q1F5 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Myo5cE9Q1F5 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Myo5cE9Q1F5 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Myo5cE9Q1F5 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Myo5cE9Q1F5 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Myo5cE9Q1F5 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Myo5cE9Q1F5 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Myo5cE9Q1F5 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Myo5cE9Q1F5 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms