Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Brd1E9PZ26 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Brd1E9PZ26 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Brd1E9PZ26 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Brd1E9PZ26 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Brd1E9PZ26 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Brd1E9PZ26 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Brd1E9PZ26 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Brd1E9PZ26 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Brd1E9PZ26 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Brd1E9PZ26 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Brd1E9PZ26 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Brd1E9PZ26 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Brd1E9PZ26 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Brd1E9PZ26 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Brd1E9PZ26 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Brd1E9PZ26 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Brd1E9PZ26 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Brd1E9PZ26 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Brd1E9PZ26 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Brd1E9PZ26 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Brd1E9PZ26 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Brd1E9PZ26 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Brd1E9PZ26 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Brd1E9PZ26 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Brd1E9PZ26 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Brd1E9PZ26 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Brd1E9PZ26 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Brd1E9PZ26 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Brd1E9PZ26 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Brd1E9PZ26 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Brd1E9PZ26 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Brd1E9PZ26 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Brd1E9PZ26 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Brd1E9PZ26 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Brd1E9PZ26 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Brd1E9PZ26 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Brd1E9PZ26 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Brd1E9PZ26 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Brd1E9PZ26 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Brd1E9PZ26 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Brd1E9PZ26 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Brd1E9PZ26 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Brd1E9PZ26 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Brd1E9PZ26 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Brd1E9PZ26 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Brd1E9PZ26 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Brd1E9PZ26 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Brd1E9PZ26 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Brd1E9PZ26 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Brd1E9PZ26 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Brd1E9PZ26 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Brd1E9PZ26 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Brd1E9PZ26 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Brd1E9PZ26 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Brd1E9PZ26 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Brd1E9PZ26 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Brd1E9PZ26 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Brd1E9PZ26 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Brd1E9PZ26 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Brd1E9PZ26 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Brd1E9PZ26 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Brd1E9PZ26 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Brd1E9PZ26 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Brd1E9PZ26 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Brd1E9PZ26 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Brd1E9PZ26 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Brd1E9PZ26 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Brd1E9PZ26 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Brd1E9PZ26 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Brd1E9PZ26 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Brd1E9PZ26 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Brd1E9PZ26 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Brd1E9PZ26 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Brd1E9PZ26 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Brd1E9PZ26 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Brd1E9PZ26 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Brd1E9PZ26 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Brd1E9PZ26 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Brd1E9PZ26 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Brd1E9PZ26 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Brd1E9PZ26 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Brd1E9PZ26 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Brd1E9PZ26 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Brd1E9PZ26 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Brd1E9PZ26 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Brd1E9PZ26 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Brd1E9PZ26 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Brd1E9PZ26 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Brd1E9PZ26 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Brd1E9PZ26 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Brd1E9PZ26 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Brd1E9PZ26 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Brd1E9PZ26 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Brd1E9PZ26 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Brd1E9PZ26 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.8 ms