Protein–RNA interactions for Protein: E9PXC0

Srp54b, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

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Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54bE9PXC0 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Srp54bE9PXC0 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Srp54bE9PXC0 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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