Protein–RNA interactions for Protein: E9PXB6

Sfta2, Surfactant-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfta2E9PXB6 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Sfta2E9PXB6 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Sfta2E9PXB6 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Sfta2E9PXB6 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Sfta2E9PXB6 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Sfta2E9PXB6 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Sfta2E9PXB6 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Sfta2E9PXB6 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Sfta2E9PXB6 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Sfta2E9PXB6 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Sfta2E9PXB6 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Sfta2E9PXB6 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Sfta2E9PXB6 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Sfta2E9PXB6 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Sfta2E9PXB6 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Sfta2E9PXB6 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Sfta2E9PXB6 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Sfta2E9PXB6 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Sfta2E9PXB6 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Sfta2E9PXB6 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Sfta2E9PXB6 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Sfta2E9PXB6 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Sfta2E9PXB6 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Sfta2E9PXB6 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Sfta2E9PXB6 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Sfta2E9PXB6 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Sfta2E9PXB6 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Sfta2E9PXB6 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Sfta2E9PXB6 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Sfta2E9PXB6 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Sfta2E9PXB6 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Sfta2E9PXB6 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Sfta2E9PXB6 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Sfta2E9PXB6 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Sfta2E9PXB6 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Sfta2E9PXB6 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Sfta2E9PXB6 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Sfta2E9PXB6 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Sfta2E9PXB6 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Sfta2E9PXB6 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Sfta2E9PXB6 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Sfta2E9PXB6 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Sfta2E9PXB6 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Sfta2E9PXB6 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Sfta2E9PXB6 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Sfta2E9PXB6 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Sfta2E9PXB6 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Sfta2E9PXB6 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Sfta2E9PXB6 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Sfta2E9PXB6 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Sfta2E9PXB6 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Sfta2E9PXB6 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Sfta2E9PXB6 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Sfta2E9PXB6 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Sfta2E9PXB6 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Sfta2E9PXB6 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Sfta2E9PXB6 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Sfta2E9PXB6 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Sfta2E9PXB6 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Sfta2E9PXB6 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Sfta2E9PXB6 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Sfta2E9PXB6 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Sfta2E9PXB6 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Sfta2E9PXB6 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Sfta2E9PXB6 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Sfta2E9PXB6 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Sfta2E9PXB6 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Sfta2E9PXB6 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Sfta2E9PXB6 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Sfta2E9PXB6 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Sfta2E9PXB6 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Sfta2E9PXB6 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Sfta2E9PXB6 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Sfta2E9PXB6 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Sfta2E9PXB6 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Sfta2E9PXB6 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Sfta2E9PXB6 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Sfta2E9PXB6 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Sfta2E9PXB6 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Sfta2E9PXB6 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Sfta2E9PXB6 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Sfta2E9PXB6 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Sfta2E9PXB6 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Sfta2E9PXB6 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Sfta2E9PXB6 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Sfta2E9PXB6 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Sfta2E9PXB6 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Sfta2E9PXB6 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Sfta2E9PXB6 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Sfta2E9PXB6 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Sfta2E9PXB6 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Sfta2E9PXB6 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Sfta2E9PXB6 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Sfta2E9PXB6 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Sfta2E9PXB6 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Sfta2E9PXB6 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Sfta2E9PXB6 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Sfta2E9PXB6 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Sfta2E9PXB6 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Sfta2E9PXB6 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms