Protein–RNA interactions for Protein: E9PW74

Gimd1, GTPase IMAP family member GIMD1, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gimd1E9PW74 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gimd1E9PW74 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gimd1E9PW74 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gimd1E9PW74 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gimd1E9PW74 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gimd1E9PW74 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gimd1E9PW74 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gimd1E9PW74 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gimd1E9PW74 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gimd1E9PW74 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gimd1E9PW74 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gimd1E9PW74 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gimd1E9PW74 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gimd1E9PW74 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gimd1E9PW74 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gimd1E9PW74 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gimd1E9PW74 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gimd1E9PW74 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gimd1E9PW74 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gimd1E9PW74 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gimd1E9PW74 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gimd1E9PW74 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gimd1E9PW74 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gimd1E9PW74 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gimd1E9PW74 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gimd1E9PW74 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gimd1E9PW74 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gimd1E9PW74 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gimd1E9PW74 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gimd1E9PW74 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gimd1E9PW74 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gimd1E9PW74 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gimd1E9PW74 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gimd1E9PW74 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gimd1E9PW74 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gimd1E9PW74 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gimd1E9PW74 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gimd1E9PW74 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gimd1E9PW74 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gimd1E9PW74 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gimd1E9PW74 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gimd1E9PW74 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gimd1E9PW74 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gimd1E9PW74 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gimd1E9PW74 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gimd1E9PW74 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gimd1E9PW74 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gimd1E9PW74 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gimd1E9PW74 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gimd1E9PW74 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gimd1E9PW74 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gimd1E9PW74 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gimd1E9PW74 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gimd1E9PW74 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gimd1E9PW74 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gimd1E9PW74 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gimd1E9PW74 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gimd1E9PW74 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gimd1E9PW74 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gimd1E9PW74 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gimd1E9PW74 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gimd1E9PW74 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gimd1E9PW74 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gimd1E9PW74 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gimd1E9PW74 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gimd1E9PW74 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gimd1E9PW74 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gimd1E9PW74 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gimd1E9PW74 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gimd1E9PW74 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gimd1E9PW74 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gimd1E9PW74 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gimd1E9PW74 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gimd1E9PW74 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gimd1E9PW74 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gimd1E9PW74 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gimd1E9PW74 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gimd1E9PW74 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gimd1E9PW74 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gimd1E9PW74 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gimd1E9PW74 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gimd1E9PW74 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gimd1E9PW74 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gimd1E9PW74 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gimd1E9PW74 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gimd1E9PW74 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gimd1E9PW74 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gimd1E9PW74 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gimd1E9PW74 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gimd1E9PW74 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gimd1E9PW74 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gimd1E9PW74 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gimd1E9PW74 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gimd1E9PW74 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gimd1E9PW74 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gimd1E9PW74 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gimd1E9PW74 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gimd1E9PW74 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gimd1E9PW74 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gimd1E9PW74 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms