Protein–RNA interactions for Protein: E9PVZ3

Ccdc144b, Coiled-coil domain-containing 144B, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc144bE9PVZ3 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc144bE9PVZ3 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms