Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB5

Ttc17, Tetratricopeptide repeat protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc17E9PVB5 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttc17E9PVB5 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ttc17E9PVB5 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ttc17E9PVB5 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ttc17E9PVB5 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ttc17E9PVB5 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ttc17E9PVB5 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ttc17E9PVB5 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ttc17E9PVB5 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttc17E9PVB5 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttc17E9PVB5 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttc17E9PVB5 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttc17E9PVB5 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttc17E9PVB5 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttc17E9PVB5 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttc17E9PVB5 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttc17E9PVB5 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttc17E9PVB5 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttc17E9PVB5 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttc17E9PVB5 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttc17E9PVB5 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms