Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syde2E9PUP1 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Syde2E9PUP1 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syde2E9PUP1 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syde2E9PUP1 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syde2E9PUP1 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Syde2E9PUP1 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syde2E9PUP1 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Syde2E9PUP1 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syde2E9PUP1 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syde2E9PUP1 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syde2E9PUP1 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syde2E9PUP1 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syde2E9PUP1 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syde2E9PUP1 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syde2E9PUP1 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syde2E9PUP1 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syde2E9PUP1 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syde2E9PUP1 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syde2E9PUP1 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syde2E9PUP1 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syde2E9PUP1 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syde2E9PUP1 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syde2E9PUP1 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syde2E9PUP1 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syde2E9PUP1 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Syde2E9PUP1 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Syde2E9PUP1 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syde2E9PUP1 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syde2E9PUP1 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syde2E9PUP1 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syde2E9PUP1 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syde2E9PUP1 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syde2E9PUP1 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syde2E9PUP1 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syde2E9PUP1 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syde2E9PUP1 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syde2E9PUP1 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syde2E9PUP1 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syde2E9PUP1 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Syde2E9PUP1 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syde2E9PUP1 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syde2E9PUP1 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syde2E9PUP1 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syde2E9PUP1 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Syde2E9PUP1 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syde2E9PUP1 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Syde2E9PUP1 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syde2E9PUP1 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syde2E9PUP1 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syde2E9PUP1 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syde2E9PUP1 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syde2E9PUP1 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syde2E9PUP1 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syde2E9PUP1 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syde2E9PUP1 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syde2E9PUP1 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syde2E9PUP1 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syde2E9PUP1 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syde2E9PUP1 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syde2E9PUP1 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syde2E9PUP1 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syde2E9PUP1 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syde2E9PUP1 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syde2E9PUP1 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syde2E9PUP1 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syde2E9PUP1 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syde2E9PUP1 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syde2E9PUP1 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Syde2E9PUP1 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Syde2E9PUP1 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Syde2E9PUP1 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syde2E9PUP1 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Syde2E9PUP1 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Syde2E9PUP1 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Syde2E9PUP1 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syde2E9PUP1 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syde2E9PUP1 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syde2E9PUP1 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syde2E9PUP1 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syde2E9PUP1 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syde2E9PUP1 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syde2E9PUP1 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syde2E9PUP1 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syde2E9PUP1 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syde2E9PUP1 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syde2E9PUP1 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syde2E9PUP1 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syde2E9PUP1 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syde2E9PUP1 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syde2E9PUP1 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syde2E9PUP1 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syde2E9PUP1 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syde2E9PUP1 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syde2E9PUP1 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syde2E9PUP1 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syde2E9PUP1 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syde2E9PUP1 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syde2E9PUP1 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syde2E9PUP1 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms