Protein–RNA interactions for Protein: D3Z235

Gm3543, Predicted gene 3543, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3543D3Z235 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3543D3Z235 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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