Protein–RNA interactions for Protein: D3YUH6

Ube2d4, Ubiquitin-conjugating enzyme E2D 4, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d4D3YUH6 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ube2d4D3YUH6 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube2d4D3YUH6 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms