Protein–RNA interactions for Protein: C3VPR6

Nlrc5, Protein NLRC5, mousemouse

Predictions only

Length 1,915 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc5C3VPR6 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrc5C3VPR6 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlrc5C3VPR6 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlrc5C3VPR6 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlrc5C3VPR6 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlrc5C3VPR6 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlrc5C3VPR6 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlrc5C3VPR6 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlrc5C3VPR6 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlrc5C3VPR6 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlrc5C3VPR6 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlrc5C3VPR6 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlrc5C3VPR6 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlrc5C3VPR6 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlrc5C3VPR6 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlrc5C3VPR6 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlrc5C3VPR6 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlrc5C3VPR6 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlrc5C3VPR6 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlrc5C3VPR6 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlrc5C3VPR6 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlrc5C3VPR6 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrc5C3VPR6 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrc5C3VPR6 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrc5C3VPR6 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrc5C3VPR6 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrc5C3VPR6 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrc5C3VPR6 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrc5C3VPR6 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrc5C3VPR6 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrc5C3VPR6 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrc5C3VPR6 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrc5C3VPR6 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrc5C3VPR6 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrc5C3VPR6 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrc5C3VPR6 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrc5C3VPR6 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrc5C3VPR6 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrc5C3VPR6 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrc5C3VPR6 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrc5C3VPR6 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrc5C3VPR6 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nlrc5C3VPR6 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nlrc5C3VPR6 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nlrc5C3VPR6 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nlrc5C3VPR6 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nlrc5C3VPR6 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nlrc5C3VPR6 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nlrc5C3VPR6 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nlrc5C3VPR6 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nlrc5C3VPR6 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nlrc5C3VPR6 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nlrc5C3VPR6 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nlrc5C3VPR6 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Nlrc5C3VPR6 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Nlrc5C3VPR6 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Nlrc5C3VPR6 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nlrc5C3VPR6 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nlrc5C3VPR6 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nlrc5C3VPR6 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nlrc5C3VPR6 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nlrc5C3VPR6 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nlrc5C3VPR6 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nlrc5C3VPR6 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nlrc5C3VPR6 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nlrc5C3VPR6 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nlrc5C3VPR6 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nlrc5C3VPR6 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nlrc5C3VPR6 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nlrc5C3VPR6 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nlrc5C3VPR6 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nlrc5C3VPR6 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nlrc5C3VPR6 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nlrc5C3VPR6 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nlrc5C3VPR6 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nlrc5C3VPR6 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nlrc5C3VPR6 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nlrc5C3VPR6 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nlrc5C3VPR6 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nlrc5C3VPR6 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nlrc5C3VPR6 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nlrc5C3VPR6 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nlrc5C3VPR6 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nlrc5C3VPR6 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nlrc5C3VPR6 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nlrc5C3VPR6 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nlrc5C3VPR6 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nlrc5C3VPR6 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nlrc5C3VPR6 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nlrc5C3VPR6 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nlrc5C3VPR6 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nlrc5C3VPR6 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nlrc5C3VPR6 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nlrc5C3VPR6 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nlrc5C3VPR6 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nlrc5C3VPR6 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nlrc5C3VPR6 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nlrc5C3VPR6 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nlrc5C3VPR6 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nlrc5C3VPR6 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.9 ms