Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

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Length 197 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rd3lB2RV38 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rd3lB2RV38 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rd3lB2RV38 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rd3lB2RV38 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rd3lB2RV38 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rd3lB2RV38 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rd3lB2RV38 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rd3lB2RV38 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rd3lB2RV38 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rd3lB2RV38 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rd3lB2RV38 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rd3lB2RV38 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rd3lB2RV38 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rd3lB2RV38 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rd3lB2RV38 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rd3lB2RV38 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rd3lB2RV38 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rd3lB2RV38 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rd3lB2RV38 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rd3lB2RV38 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rd3lB2RV38 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rd3lB2RV38 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rd3lB2RV38 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rd3lB2RV38 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rd3lB2RV38 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rd3lB2RV38 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rd3lB2RV38 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rd3lB2RV38 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Rd3lB2RV38 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rd3lB2RV38 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rd3lB2RV38 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Rd3lB2RV38 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rd3lB2RV38 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rd3lB2RV38 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rd3lB2RV38 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rd3lB2RV38 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Rd3lB2RV38 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rd3lB2RV38 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Rd3lB2RV38 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rd3lB2RV38 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rd3lB2RV38 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Rd3lB2RV38 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Rd3lB2RV38 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rd3lB2RV38 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Rd3lB2RV38 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rd3lB2RV38 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rd3lB2RV38 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rd3lB2RV38 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Rd3lB2RV38 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rd3lB2RV38 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Rd3lB2RV38 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rd3lB2RV38 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Rd3lB2RV38 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rd3lB2RV38 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rd3lB2RV38 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rd3lB2RV38 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rd3lB2RV38 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rd3lB2RV38 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rd3lB2RV38 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rd3lB2RV38 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rd3lB2RV38 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rd3lB2RV38 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rd3lB2RV38 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rd3lB2RV38 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rd3lB2RV38 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rd3lB2RV38 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rd3lB2RV38 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rd3lB2RV38 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rd3lB2RV38 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rd3lB2RV38 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rd3lB2RV38 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rd3lB2RV38 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
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