Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

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Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rrn3B2RS91 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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