Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Brpf1B2RRD7 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Brpf1B2RRD7 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Brpf1B2RRD7 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Brpf1B2RRD7 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Brpf1B2RRD7 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Brpf1B2RRD7 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Brpf1B2RRD7 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Brpf1B2RRD7 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Brpf1B2RRD7 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Brpf1B2RRD7 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Brpf1B2RRD7 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Brpf1B2RRD7 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Brpf1B2RRD7 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Brpf1B2RRD7 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Brpf1B2RRD7 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Brpf1B2RRD7 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Brpf1B2RRD7 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Brpf1B2RRD7 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Brpf1B2RRD7 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Brpf1B2RRD7 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Brpf1B2RRD7 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Brpf1B2RRD7 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Brpf1B2RRD7 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Brpf1B2RRD7 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Brpf1B2RRD7 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Brpf1B2RRD7 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Brpf1B2RRD7 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Brpf1B2RRD7 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Brpf1B2RRD7 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brpf1B2RRD7 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brpf1B2RRD7 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brpf1B2RRD7 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brpf1B2RRD7 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Brpf1B2RRD7 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brpf1B2RRD7 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brpf1B2RRD7 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brpf1B2RRD7 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brpf1B2RRD7 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brpf1B2RRD7 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brpf1B2RRD7 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brpf1B2RRD7 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brpf1B2RRD7 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Brpf1B2RRD7 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brpf1B2RRD7 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brpf1B2RRD7 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brpf1B2RRD7 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Brpf1B2RRD7 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Brpf1B2RRD7 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Brpf1B2RRD7 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Brpf1B2RRD7 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Brpf1B2RRD7 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Brpf1B2RRD7 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Brpf1B2RRD7 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Brpf1B2RRD7 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Brpf1B2RRD7 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Brpf1B2RRD7 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Brpf1B2RRD7 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Brpf1B2RRD7 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Brpf1B2RRD7 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Brpf1B2RRD7 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Brpf1B2RRD7 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Brpf1B2RRD7 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Brpf1B2RRD7 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Brpf1B2RRD7 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Brpf1B2RRD7 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Brpf1B2RRD7 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Brpf1B2RRD7 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Brpf1B2RRD7 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Brpf1B2RRD7 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Brpf1B2RRD7 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Brpf1B2RRD7 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Brpf1B2RRD7 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Brpf1B2RRD7 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Brpf1B2RRD7 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Brpf1B2RRD7 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Brpf1B2RRD7 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Brpf1B2RRD7 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Brpf1B2RRD7 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Brpf1B2RRD7 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Brpf1B2RRD7 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Brpf1B2RRD7 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Brpf1B2RRD7 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Brpf1B2RRD7 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Brpf1B2RRD7 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Brpf1B2RRD7 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Brpf1B2RRD7 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Brpf1B2RRD7 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Brpf1B2RRD7 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Brpf1B2RRD7 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Brpf1B2RRD7 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Brpf1B2RRD7 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Brpf1B2RRD7 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Brpf1B2RRD7 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Brpf1B2RRD7 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Brpf1B2RRD7 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Brpf1B2RRD7 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Brpf1B2RRD7 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Brpf1B2RRD7 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Brpf1B2RRD7 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms