Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Uhrf1bp1B2KF50 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Uhrf1bp1B2KF50 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Uhrf1bp1B2KF50 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Uhrf1bp1B2KF50 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Uhrf1bp1B2KF50 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Uhrf1bp1B2KF50 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Uhrf1bp1B2KF50 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Uhrf1bp1B2KF50 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Uhrf1bp1B2KF50 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Uhrf1bp1B2KF50 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Uhrf1bp1B2KF50 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Uhrf1bp1B2KF50 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Uhrf1bp1B2KF50 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Uhrf1bp1B2KF50 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Uhrf1bp1B2KF50 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Uhrf1bp1B2KF50 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Uhrf1bp1B2KF50 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Uhrf1bp1B2KF50 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Uhrf1bp1B2KF50 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Uhrf1bp1B2KF50 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Uhrf1bp1B2KF50 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Uhrf1bp1B2KF50 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Uhrf1bp1B2KF50 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Uhrf1bp1B2KF50 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Uhrf1bp1B2KF50 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Uhrf1bp1B2KF50 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Uhrf1bp1B2KF50 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Uhrf1bp1B2KF50 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Uhrf1bp1B2KF50 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Uhrf1bp1B2KF50 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Uhrf1bp1B2KF50 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Uhrf1bp1B2KF50 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Uhrf1bp1B2KF50 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Uhrf1bp1B2KF50 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Uhrf1bp1B2KF50 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Uhrf1bp1B2KF50 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Uhrf1bp1B2KF50 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Uhrf1bp1B2KF50 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Uhrf1bp1B2KF50 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Uhrf1bp1B2KF50 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Uhrf1bp1B2KF50 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Uhrf1bp1B2KF50 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Uhrf1bp1B2KF50 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Uhrf1bp1B2KF50 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Uhrf1bp1B2KF50 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Uhrf1bp1B2KF50 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Uhrf1bp1B2KF50 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Uhrf1bp1B2KF50 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Uhrf1bp1B2KF50 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Uhrf1bp1B2KF50 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Uhrf1bp1B2KF50 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Uhrf1bp1B2KF50 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Uhrf1bp1B2KF50 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Uhrf1bp1B2KF50 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Uhrf1bp1B2KF50 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Uhrf1bp1B2KF50 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Uhrf1bp1B2KF50 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Uhrf1bp1B2KF50 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Uhrf1bp1B2KF50 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Uhrf1bp1B2KF50 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Uhrf1bp1B2KF50 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Uhrf1bp1B2KF50 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Uhrf1bp1B2KF50 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Uhrf1bp1B2KF50 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Uhrf1bp1B2KF50 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Uhrf1bp1B2KF50 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Uhrf1bp1B2KF50 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Uhrf1bp1B2KF50 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Uhrf1bp1B2KF50 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Uhrf1bp1B2KF50 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Uhrf1bp1B2KF50 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Uhrf1bp1B2KF50 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Uhrf1bp1B2KF50 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Uhrf1bp1B2KF50 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Uhrf1bp1B2KF50 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Uhrf1bp1B2KF50 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Uhrf1bp1B2KF50 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Uhrf1bp1B2KF50 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Uhrf1bp1B2KF50 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Uhrf1bp1B2KF50 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Uhrf1bp1B2KF50 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Uhrf1bp1B2KF50 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Uhrf1bp1B2KF50 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Uhrf1bp1B2KF50 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Uhrf1bp1B2KF50 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Uhrf1bp1B2KF50 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Uhrf1bp1B2KF50 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Uhrf1bp1B2KF50 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Uhrf1bp1B2KF50 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Uhrf1bp1B2KF50 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Uhrf1bp1B2KF50 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Uhrf1bp1B2KF50 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Uhrf1bp1B2KF50 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Uhrf1bp1B2KF50 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Uhrf1bp1B2KF50 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Uhrf1bp1B2KF50 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Uhrf1bp1B2KF50 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms