Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
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Trabd2bB1ATG9 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
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Trabd2bB1ATG9 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Trabd2bB1ATG9 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
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Trabd2bB1ATG9 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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