Protein–RNA interactions for Protein: A6X8Z9

4930435E12Rik, RIKEN cDNA 4930435E12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930435E12RikA6X8Z9 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
4930435E12RikA6X8Z9 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
4930435E12RikA6X8Z9 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
4930435E12RikA6X8Z9 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
4930435E12RikA6X8Z9 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
4930435E12RikA6X8Z9 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
4930435E12RikA6X8Z9 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
4930435E12RikA6X8Z9 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
4930435E12RikA6X8Z9 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
4930435E12RikA6X8Z9 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
4930435E12RikA6X8Z9 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
4930435E12RikA6X8Z9 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
4930435E12RikA6X8Z9 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
4930435E12RikA6X8Z9 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
4930435E12RikA6X8Z9 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
4930435E12RikA6X8Z9 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
4930435E12RikA6X8Z9 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
4930435E12RikA6X8Z9 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
4930435E12RikA6X8Z9 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
4930435E12RikA6X8Z9 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
4930435E12RikA6X8Z9 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
4930435E12RikA6X8Z9 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
4930435E12RikA6X8Z9 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
4930435E12RikA6X8Z9 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
4930435E12RikA6X8Z9 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
4930435E12RikA6X8Z9 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
4930435E12RikA6X8Z9 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
4930435E12RikA6X8Z9 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
4930435E12RikA6X8Z9 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
4930435E12RikA6X8Z9 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
4930435E12RikA6X8Z9 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
4930435E12RikA6X8Z9 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930435E12RikA6X8Z9 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930435E12RikA6X8Z9 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930435E12RikA6X8Z9 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930435E12RikA6X8Z9 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930435E12RikA6X8Z9 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930435E12RikA6X8Z9 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930435E12RikA6X8Z9 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930435E12RikA6X8Z9 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930435E12RikA6X8Z9 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930435E12RikA6X8Z9 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930435E12RikA6X8Z9 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930435E12RikA6X8Z9 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930435E12RikA6X8Z9 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930435E12RikA6X8Z9 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930435E12RikA6X8Z9 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930435E12RikA6X8Z9 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930435E12RikA6X8Z9 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
4930435E12RikA6X8Z9 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930435E12RikA6X8Z9 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930435E12RikA6X8Z9 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930435E12RikA6X8Z9 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930435E12RikA6X8Z9 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
4930435E12RikA6X8Z9 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
4930435E12RikA6X8Z9 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930435E12RikA6X8Z9 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930435E12RikA6X8Z9 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930435E12RikA6X8Z9 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930435E12RikA6X8Z9 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930435E12RikA6X8Z9 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930435E12RikA6X8Z9 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930435E12RikA6X8Z9 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930435E12RikA6X8Z9 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930435E12RikA6X8Z9 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930435E12RikA6X8Z9 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930435E12RikA6X8Z9 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930435E12RikA6X8Z9 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930435E12RikA6X8Z9 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930435E12RikA6X8Z9 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930435E12RikA6X8Z9 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930435E12RikA6X8Z9 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930435E12RikA6X8Z9 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930435E12RikA6X8Z9 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930435E12RikA6X8Z9 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930435E12RikA6X8Z9 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930435E12RikA6X8Z9 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930435E12RikA6X8Z9 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930435E12RikA6X8Z9 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930435E12RikA6X8Z9 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930435E12RikA6X8Z9 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
4930435E12RikA6X8Z9 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930435E12RikA6X8Z9 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930435E12RikA6X8Z9 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930435E12RikA6X8Z9 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
4930435E12RikA6X8Z9 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
4930435E12RikA6X8Z9 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930435E12RikA6X8Z9 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930435E12RikA6X8Z9 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930435E12RikA6X8Z9 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930435E12RikA6X8Z9 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930435E12RikA6X8Z9 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930435E12RikA6X8Z9 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930435E12RikA6X8Z9 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930435E12RikA6X8Z9 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930435E12RikA6X8Z9 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930435E12RikA6X8Z9 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930435E12RikA6X8Z9 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930435E12RikA6X8Z9 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930435E12RikA6X8Z9 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms