Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Odf2A3KGV1 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Odf2A3KGV1 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Odf2A3KGV1 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Odf2A3KGV1 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Odf2A3KGV1 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Odf2A3KGV1 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Odf2A3KGV1 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Odf2A3KGV1 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Odf2A3KGV1 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Odf2A3KGV1 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms