Protein–RNA interactions for Protein: A3KGF7

Plcb2, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plcb2A3KGF7 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Plcb2A3KGF7 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Plcb2A3KGF7 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Plcb2A3KGF7 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Plcb2A3KGF7 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Plcb2A3KGF7 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Plcb2A3KGF7 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Plcb2A3KGF7 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Plcb2A3KGF7 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Plcb2A3KGF7 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Plcb2A3KGF7 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Plcb2A3KGF7 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Plcb2A3KGF7 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Plcb2A3KGF7 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Plcb2A3KGF7 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Plcb2A3KGF7 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Plcb2A3KGF7 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Plcb2A3KGF7 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Plcb2A3KGF7 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Plcb2A3KGF7 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Plcb2A3KGF7 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Plcb2A3KGF7 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Plcb2A3KGF7 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Plcb2A3KGF7 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Plcb2A3KGF7 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Plcb2A3KGF7 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Plcb2A3KGF7 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Plcb2A3KGF7 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Plcb2A3KGF7 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Plcb2A3KGF7 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Plcb2A3KGF7 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Plcb2A3KGF7 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Plcb2A3KGF7 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Plcb2A3KGF7 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Plcb2A3KGF7 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Plcb2A3KGF7 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Plcb2A3KGF7 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Plcb2A3KGF7 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Plcb2A3KGF7 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Plcb2A3KGF7 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Plcb2A3KGF7 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Plcb2A3KGF7 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Plcb2A3KGF7 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Plcb2A3KGF7 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Plcb2A3KGF7 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Plcb2A3KGF7 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Plcb2A3KGF7 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Plcb2A3KGF7 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Plcb2A3KGF7 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Plcb2A3KGF7 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Plcb2A3KGF7 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Plcb2A3KGF7 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Plcb2A3KGF7 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Plcb2A3KGF7 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Plcb2A3KGF7 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Plcb2A3KGF7 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Plcb2A3KGF7 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Plcb2A3KGF7 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Plcb2A3KGF7 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Plcb2A3KGF7 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Plcb2A3KGF7 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Plcb2A3KGF7 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Plcb2A3KGF7 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Plcb2A3KGF7 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Plcb2A3KGF7 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Plcb2A3KGF7 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Plcb2A3KGF7 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Plcb2A3KGF7 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Plcb2A3KGF7 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Plcb2A3KGF7 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Plcb2A3KGF7 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Plcb2A3KGF7 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Plcb2A3KGF7 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Plcb2A3KGF7 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Plcb2A3KGF7 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Plcb2A3KGF7 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Plcb2A3KGF7 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Plcb2A3KGF7 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Plcb2A3KGF7 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Plcb2A3KGF7 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Plcb2A3KGF7 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Plcb2A3KGF7 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Plcb2A3KGF7 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Plcb2A3KGF7 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Plcb2A3KGF7 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Plcb2A3KGF7 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Plcb2A3KGF7 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Plcb2A3KGF7 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Plcb2A3KGF7 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Plcb2A3KGF7 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Plcb2A3KGF7 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Plcb2A3KGF7 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Plcb2A3KGF7 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Plcb2A3KGF7 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Plcb2A3KGF7 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Plcb2A3KGF7 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Plcb2A3KGF7 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Plcb2A3KGF7 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Plcb2A3KGF7 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Plcb2A3KGF7 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms