Protein–RNA interactions for Protein: A2ATD1

Ism1, Isthmin-1, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ism1A2ATD1 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ism1A2ATD1 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ism1A2ATD1 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ism1A2ATD1 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ism1A2ATD1 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ism1A2ATD1 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ism1A2ATD1 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ism1A2ATD1 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ism1A2ATD1 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ism1A2ATD1 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ism1A2ATD1 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ism1A2ATD1 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ism1A2ATD1 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ism1A2ATD1 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ism1A2ATD1 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ism1A2ATD1 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ism1A2ATD1 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ism1A2ATD1 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ism1A2ATD1 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ism1A2ATD1 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ism1A2ATD1 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ism1A2ATD1 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ism1A2ATD1 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ism1A2ATD1 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ism1A2ATD1 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ism1A2ATD1 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ism1A2ATD1 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ism1A2ATD1 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ism1A2ATD1 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ism1A2ATD1 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ism1A2ATD1 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ism1A2ATD1 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ism1A2ATD1 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ism1A2ATD1 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ism1A2ATD1 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ism1A2ATD1 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ism1A2ATD1 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ism1A2ATD1 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ism1A2ATD1 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ism1A2ATD1 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ism1A2ATD1 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ism1A2ATD1 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ism1A2ATD1 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ism1A2ATD1 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ism1A2ATD1 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ism1A2ATD1 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ism1A2ATD1 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ism1A2ATD1 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ism1A2ATD1 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ism1A2ATD1 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ism1A2ATD1 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ism1A2ATD1 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ism1A2ATD1 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ism1A2ATD1 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ism1A2ATD1 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ism1A2ATD1 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ism1A2ATD1 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ism1A2ATD1 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ism1A2ATD1 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ism1A2ATD1 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ism1A2ATD1 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ism1A2ATD1 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ism1A2ATD1 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ism1A2ATD1 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ism1A2ATD1 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ism1A2ATD1 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ism1A2ATD1 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ism1A2ATD1 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ism1A2ATD1 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ism1A2ATD1 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ism1A2ATD1 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ism1A2ATD1 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ism1A2ATD1 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ism1A2ATD1 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ism1A2ATD1 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ism1A2ATD1 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ism1A2ATD1 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ism1A2ATD1 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ism1A2ATD1 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ism1A2ATD1 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ism1A2ATD1 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ism1A2ATD1 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ism1A2ATD1 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ism1A2ATD1 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ism1A2ATD1 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ism1A2ATD1 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ism1A2ATD1 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ism1A2ATD1 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ism1A2ATD1 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ism1A2ATD1 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ism1A2ATD1 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ism1A2ATD1 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ism1A2ATD1 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ism1A2ATD1 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ism1A2ATD1 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ism1A2ATD1 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ism1A2ATD1 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ism1A2ATD1 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ism1A2ATD1 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ism1A2ATD1 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms