Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scn3aA2ASI5 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scn3aA2ASI5 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Scn3aA2ASI5 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scn3aA2ASI5 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scn3aA2ASI5 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scn3aA2ASI5 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scn3aA2ASI5 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Scn3aA2ASI5 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Scn3aA2ASI5 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Scn3aA2ASI5 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scn3aA2ASI5 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scn3aA2ASI5 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scn3aA2ASI5 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scn3aA2ASI5 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scn3aA2ASI5 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scn3aA2ASI5 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scn3aA2ASI5 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scn3aA2ASI5 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scn3aA2ASI5 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scn3aA2ASI5 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scn3aA2ASI5 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scn3aA2ASI5 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scn3aA2ASI5 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Scn3aA2ASI5 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scn3aA2ASI5 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scn3aA2ASI5 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scn3aA2ASI5 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Scn3aA2ASI5 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scn3aA2ASI5 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scn3aA2ASI5 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scn3aA2ASI5 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scn3aA2ASI5 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scn3aA2ASI5 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scn3aA2ASI5 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scn3aA2ASI5 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scn3aA2ASI5 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scn3aA2ASI5 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scn3aA2ASI5 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scn3aA2ASI5 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scn3aA2ASI5 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scn3aA2ASI5 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scn3aA2ASI5 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scn3aA2ASI5 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scn3aA2ASI5 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scn3aA2ASI5 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scn3aA2ASI5 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scn3aA2ASI5 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Scn3aA2ASI5 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scn3aA2ASI5 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scn3aA2ASI5 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scn3aA2ASI5 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scn3aA2ASI5 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scn3aA2ASI5 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scn3aA2ASI5 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scn3aA2ASI5 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scn3aA2ASI5 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scn3aA2ASI5 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scn3aA2ASI5 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scn3aA2ASI5 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scn3aA2ASI5 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scn3aA2ASI5 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scn3aA2ASI5 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Scn3aA2ASI5 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scn3aA2ASI5 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scn3aA2ASI5 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scn3aA2ASI5 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scn3aA2ASI5 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scn3aA2ASI5 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scn3aA2ASI5 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scn3aA2ASI5 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Scn3aA2ASI5 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scn3aA2ASI5 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scn3aA2ASI5 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scn3aA2ASI5 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scn3aA2ASI5 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scn3aA2ASI5 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scn3aA2ASI5 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scn3aA2ASI5 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scn3aA2ASI5 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scn3aA2ASI5 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scn3aA2ASI5 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scn3aA2ASI5 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scn3aA2ASI5 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scn3aA2ASI5 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scn3aA2ASI5 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scn3aA2ASI5 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scn3aA2ASI5 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scn3aA2ASI5 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scn3aA2ASI5 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scn3aA2ASI5 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scn3aA2ASI5 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scn3aA2ASI5 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scn3aA2ASI5 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scn3aA2ASI5 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scn3aA2ASI5 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Scn3aA2ASI5 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scn3aA2ASI5 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scn3aA2ASI5 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scn3aA2ASI5 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms