Protein–RNA interactions for Protein: A2ARP9

Catsper2, Cation channel sperm-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Catsper2A2ARP9 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Catsper2A2ARP9 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Catsper2A2ARP9 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Catsper2A2ARP9 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Catsper2A2ARP9 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Catsper2A2ARP9 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Catsper2A2ARP9 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Catsper2A2ARP9 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Catsper2A2ARP9 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Catsper2A2ARP9 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Catsper2A2ARP9 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Catsper2A2ARP9 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Catsper2A2ARP9 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Catsper2A2ARP9 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Catsper2A2ARP9 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Catsper2A2ARP9 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Catsper2A2ARP9 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Catsper2A2ARP9 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Catsper2A2ARP9 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Catsper2A2ARP9 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Catsper2A2ARP9 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Catsper2A2ARP9 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Catsper2A2ARP9 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Catsper2A2ARP9 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Catsper2A2ARP9 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Catsper2A2ARP9 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Catsper2A2ARP9 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Catsper2A2ARP9 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Catsper2A2ARP9 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Catsper2A2ARP9 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Catsper2A2ARP9 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Catsper2A2ARP9 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Catsper2A2ARP9 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Catsper2A2ARP9 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Catsper2A2ARP9 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Catsper2A2ARP9 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Catsper2A2ARP9 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Catsper2A2ARP9 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Catsper2A2ARP9 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Catsper2A2ARP9 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Catsper2A2ARP9 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Catsper2A2ARP9 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Catsper2A2ARP9 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Catsper2A2ARP9 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Catsper2A2ARP9 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Catsper2A2ARP9 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Catsper2A2ARP9 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Catsper2A2ARP9 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Catsper2A2ARP9 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Catsper2A2ARP9 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Catsper2A2ARP9 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Catsper2A2ARP9 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Catsper2A2ARP9 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Catsper2A2ARP9 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Catsper2A2ARP9 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Catsper2A2ARP9 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Catsper2A2ARP9 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Catsper2A2ARP9 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Catsper2A2ARP9 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Catsper2A2ARP9 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Catsper2A2ARP9 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Catsper2A2ARP9 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Catsper2A2ARP9 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Catsper2A2ARP9 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Catsper2A2ARP9 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Catsper2A2ARP9 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Catsper2A2ARP9 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Catsper2A2ARP9 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Catsper2A2ARP9 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Catsper2A2ARP9 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Catsper2A2ARP9 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Catsper2A2ARP9 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Catsper2A2ARP9 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Catsper2A2ARP9 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Catsper2A2ARP9 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Catsper2A2ARP9 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Catsper2A2ARP9 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Catsper2A2ARP9 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Catsper2A2ARP9 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Catsper2A2ARP9 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Catsper2A2ARP9 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Catsper2A2ARP9 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Catsper2A2ARP9 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Catsper2A2ARP9 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Catsper2A2ARP9 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Catsper2A2ARP9 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Catsper2A2ARP9 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Catsper2A2ARP9 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Catsper2A2ARP9 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Catsper2A2ARP9 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Catsper2A2ARP9 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Catsper2A2ARP9 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Catsper2A2ARP9 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Catsper2A2ARP9 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Catsper2A2ARP9 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Catsper2A2ARP9 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Catsper2A2ARP9 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Catsper2A2ARP9 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Catsper2A2ARP9 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Catsper2A2ARP9 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms