Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rtf1A2AQ19 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rtf1A2AQ19 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rtf1A2AQ19 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rtf1A2AQ19 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rtf1A2AQ19 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rtf1A2AQ19 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Rtf1A2AQ19 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
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Rtf1A2AQ19 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
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Rtf1A2AQ19 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rtf1A2AQ19 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rtf1A2AQ19 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rtf1A2AQ19 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
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Rtf1A2AQ19 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rtf1A2AQ19 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rtf1A2AQ19 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rtf1A2AQ19 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rtf1A2AQ19 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
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Rtf1A2AQ19 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rtf1A2AQ19 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rtf1A2AQ19 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
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Rtf1A2AQ19 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Rtf1A2AQ19 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rtf1A2AQ19 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
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Rtf1A2AQ19 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
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Rtf1A2AQ19 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rtf1A2AQ19 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
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Rtf1A2AQ19 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
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Rtf1A2AQ19 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
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Rtf1A2AQ19 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
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Rtf1A2AQ19 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rtf1A2AQ19 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rtf1A2AQ19 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
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Rtf1A2AQ19 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rtf1A2AQ19 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
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Rtf1A2AQ19 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Rtf1A2AQ19 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rtf1A2AQ19 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rtf1A2AQ19 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rtf1A2AQ19 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
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Rtf1A2AQ19 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rtf1A2AQ19 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rtf1A2AQ19 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rtf1A2AQ19 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Rtf1A2AQ19 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rtf1A2AQ19 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
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