Protein–RNA interactions for Protein: A2APX8

Scn1a, Sodium channel protein type 1 subunit alpha, mousemouse

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Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1aA2APX8 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scn1aA2APX8 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scn1aA2APX8 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scn1aA2APX8 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scn1aA2APX8 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scn1aA2APX8 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scn1aA2APX8 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scn1aA2APX8 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scn1aA2APX8 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scn1aA2APX8 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scn1aA2APX8 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scn1aA2APX8 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scn1aA2APX8 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Scn1aA2APX8 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scn1aA2APX8 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scn1aA2APX8 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scn1aA2APX8 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scn1aA2APX8 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scn1aA2APX8 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scn1aA2APX8 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Scn1aA2APX8 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scn1aA2APX8 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scn1aA2APX8 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scn1aA2APX8 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scn1aA2APX8 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scn1aA2APX8 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scn1aA2APX8 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scn1aA2APX8 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scn1aA2APX8 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scn1aA2APX8 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scn1aA2APX8 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scn1aA2APX8 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scn1aA2APX8 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scn1aA2APX8 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scn1aA2APX8 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scn1aA2APX8 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scn1aA2APX8 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scn1aA2APX8 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scn1aA2APX8 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scn1aA2APX8 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scn1aA2APX8 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scn1aA2APX8 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Scn1aA2APX8 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scn1aA2APX8 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scn1aA2APX8 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scn1aA2APX8 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scn1aA2APX8 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scn1aA2APX8 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Scn1aA2APX8 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Scn1aA2APX8 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Scn1aA2APX8 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scn1aA2APX8 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scn1aA2APX8 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn1aA2APX8 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn1aA2APX8 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn1aA2APX8 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn1aA2APX8 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn1aA2APX8 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn1aA2APX8 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn1aA2APX8 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn1aA2APX8 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Scn1aA2APX8 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn1aA2APX8 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Scn1aA2APX8 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn1aA2APX8 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn1aA2APX8 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn1aA2APX8 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn1aA2APX8 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn1aA2APX8 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn1aA2APX8 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn1aA2APX8 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn1aA2APX8 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn1aA2APX8 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn1aA2APX8 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn1aA2APX8 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn1aA2APX8 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn1aA2APX8 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn1aA2APX8 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn1aA2APX8 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn1aA2APX8 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn1aA2APX8 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn1aA2APX8 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn1aA2APX8 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn1aA2APX8 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn1aA2APX8 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn1aA2APX8 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn1aA2APX8 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn1aA2APX8 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn1aA2APX8 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn1aA2APX8 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn1aA2APX8 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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