Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CtcflA2APF3 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CtcflA2APF3 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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