Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Syndig1A2ANU3 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Syndig1A2ANU3 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.5 ms