Protein–RNA interactions for Protein: A2AKB4

Frmpd1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd1A2AKB4 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Frmpd1A2AKB4 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Frmpd1A2AKB4 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Frmpd1A2AKB4 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Frmpd1A2AKB4 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Frmpd1A2AKB4 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Frmpd1A2AKB4 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Frmpd1A2AKB4 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Frmpd1A2AKB4 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Frmpd1A2AKB4 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Frmpd1A2AKB4 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Frmpd1A2AKB4 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Frmpd1A2AKB4 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Frmpd1A2AKB4 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Frmpd1A2AKB4 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Frmpd1A2AKB4 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Frmpd1A2AKB4 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Frmpd1A2AKB4 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Frmpd1A2AKB4 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Frmpd1A2AKB4 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Frmpd1A2AKB4 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Frmpd1A2AKB4 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Frmpd1A2AKB4 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Frmpd1A2AKB4 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Frmpd1A2AKB4 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Frmpd1A2AKB4 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Frmpd1A2AKB4 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Frmpd1A2AKB4 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Frmpd1A2AKB4 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Frmpd1A2AKB4 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Frmpd1A2AKB4 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Frmpd1A2AKB4 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Frmpd1A2AKB4 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Frmpd1A2AKB4 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Frmpd1A2AKB4 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Frmpd1A2AKB4 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Frmpd1A2AKB4 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Frmpd1A2AKB4 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Frmpd1A2AKB4 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Frmpd1A2AKB4 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Frmpd1A2AKB4 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Frmpd1A2AKB4 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Frmpd1A2AKB4 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Frmpd1A2AKB4 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Frmpd1A2AKB4 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Frmpd1A2AKB4 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Frmpd1A2AKB4 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Frmpd1A2AKB4 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Frmpd1A2AKB4 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Frmpd1A2AKB4 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Frmpd1A2AKB4 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Frmpd1A2AKB4 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Frmpd1A2AKB4 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Frmpd1A2AKB4 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Frmpd1A2AKB4 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Frmpd1A2AKB4 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Frmpd1A2AKB4 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Frmpd1A2AKB4 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Frmpd1A2AKB4 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Frmpd1A2AKB4 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Frmpd1A2AKB4 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Frmpd1A2AKB4 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Frmpd1A2AKB4 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Frmpd1A2AKB4 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Frmpd1A2AKB4 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Frmpd1A2AKB4 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Frmpd1A2AKB4 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Frmpd1A2AKB4 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Frmpd1A2AKB4 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Frmpd1A2AKB4 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Frmpd1A2AKB4 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Frmpd1A2AKB4 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Frmpd1A2AKB4 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Frmpd1A2AKB4 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Frmpd1A2AKB4 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Frmpd1A2AKB4 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Frmpd1A2AKB4 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Frmpd1A2AKB4 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Frmpd1A2AKB4 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Frmpd1A2AKB4 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Frmpd1A2AKB4 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Frmpd1A2AKB4 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Frmpd1A2AKB4 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Frmpd1A2AKB4 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Frmpd1A2AKB4 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Frmpd1A2AKB4 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Frmpd1A2AKB4 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Frmpd1A2AKB4 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Frmpd1A2AKB4 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Frmpd1A2AKB4 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Frmpd1A2AKB4 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Frmpd1A2AKB4 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Frmpd1A2AKB4 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Frmpd1A2AKB4 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Frmpd1A2AKB4 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Frmpd1A2AKB4 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Frmpd1A2AKB4 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Frmpd1A2AKB4 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Frmpd1A2AKB4 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Frmpd1A2AKB4 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms