Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PtprfA2A8L5 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PtprfA2A8L5 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PtprfA2A8L5 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PtprfA2A8L5 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PtprfA2A8L5 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PtprfA2A8L5 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PtprfA2A8L5 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PtprfA2A8L5 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PtprfA2A8L5 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PtprfA2A8L5 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PtprfA2A8L5 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PtprfA2A8L5 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PtprfA2A8L5 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PtprfA2A8L5 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PtprfA2A8L5 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PtprfA2A8L5 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PtprfA2A8L5 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PtprfA2A8L5 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PtprfA2A8L5 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PtprfA2A8L5 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PtprfA2A8L5 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PtprfA2A8L5 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PtprfA2A8L5 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PtprfA2A8L5 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PtprfA2A8L5 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PtprfA2A8L5 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PtprfA2A8L5 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PtprfA2A8L5 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PtprfA2A8L5 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PtprfA2A8L5 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PtprfA2A8L5 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PtprfA2A8L5 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PtprfA2A8L5 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PtprfA2A8L5 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PtprfA2A8L5 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PtprfA2A8L5 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PtprfA2A8L5 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PtprfA2A8L5 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PtprfA2A8L5 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PtprfA2A8L5 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PtprfA2A8L5 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PtprfA2A8L5 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PtprfA2A8L5 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PtprfA2A8L5 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PtprfA2A8L5 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PtprfA2A8L5 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PtprfA2A8L5 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PtprfA2A8L5 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PtprfA2A8L5 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PtprfA2A8L5 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PtprfA2A8L5 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PtprfA2A8L5 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PtprfA2A8L5 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PtprfA2A8L5 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PtprfA2A8L5 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PtprfA2A8L5 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PtprfA2A8L5 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PtprfA2A8L5 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PtprfA2A8L5 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PtprfA2A8L5 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PtprfA2A8L5 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PtprfA2A8L5 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PtprfA2A8L5 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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PtprfA2A8L5 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PtprfA2A8L5 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PtprfA2A8L5 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PtprfA2A8L5 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PtprfA2A8L5 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PtprfA2A8L5 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PtprfA2A8L5 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PtprfA2A8L5 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PtprfA2A8L5 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PtprfA2A8L5 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PtprfA2A8L5 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PtprfA2A8L5 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PtprfA2A8L5 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PtprfA2A8L5 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PtprfA2A8L5 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PtprfA2A8L5 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PtprfA2A8L5 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PtprfA2A8L5 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PtprfA2A8L5 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PtprfA2A8L5 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PtprfA2A8L5 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
PtprfA2A8L5 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PtprfA2A8L5 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
PtprfA2A8L5 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
PtprfA2A8L5 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PtprfA2A8L5 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PtprfA2A8L5 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PtprfA2A8L5 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PtprfA2A8L5 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PtprfA2A8L5 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PtprfA2A8L5 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PtprfA2A8L5 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PtprfA2A8L5 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PtprfA2A8L5 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PtprfA2A8L5 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms