Protein–RNA interactions for Protein: A0N8N6

Trav12-2, T cell receptor alpha variable 12-2 (Fragment), mousemouse

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav12-2A0N8N6 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trav12-2A0N8N6 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trav12-2A0N8N6 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trav12-2A0N8N6 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trav12-2A0N8N6 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trav12-2A0N8N6 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trav12-2A0N8N6 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trav12-2A0N8N6 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Trav12-2A0N8N6 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trav12-2A0N8N6 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Trav12-2A0N8N6 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Trav12-2A0N8N6 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Trav12-2A0N8N6 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trav12-2A0N8N6 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trav12-2A0N8N6 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Trav12-2A0N8N6 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Trav12-2A0N8N6 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Trav12-2A0N8N6 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trav12-2A0N8N6 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trav12-2A0N8N6 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trav12-2A0N8N6 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trav12-2A0N8N6 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trav12-2A0N8N6 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trav12-2A0N8N6 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trav12-2A0N8N6 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Trav12-2A0N8N6 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trav12-2A0N8N6 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trav12-2A0N8N6 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trav12-2A0N8N6 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trav12-2A0N8N6 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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